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讓長讀取來拯救基因組組裝

新一代測序的出現(xiàn)，讓科學家們能夠更快地實現(xiàn)基因組測序，且成本比Sanger測序要低得多。但是，這是以犧牲讀長為代價的，平均讀長從Sanger測序時的800-900bp降低如今的100bp左右。短的讀長讓基因組組裝更加困難，因為需要更深度覆蓋才能產生相當?shù)慕M裝。為了解決這一問題，Worley及其同事近轉向了PacificBiosciences公司的PacBioRS平臺。然而，有些問題是更深度覆蓋也無法彌補的。對于denovo組裝，長度超過讀長的重復序列會產生缺口，導致近年來更多...

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細胞化學染色方法

實驗原理1.細胞經甲基綠一呱咯寧混合液處理后，其中的DNA和RNA出現(xiàn)不同的呈色反應，一般認為這是由于帶有負電荷的核酸對堿性染料呱咯寧和甲基綠具有親和力，且這兩種染料的作用有選擇性，甲基綠染高聚分子的DNA呈藍綠色，呱咯寧染低聚分子的RNA呈紅色。由此對細胞中的DNA和RNA進行定位、定性、和定量分析。2.由于不同的蛋白質分子所帶的堿性和酸性基團的數(shù)目不同，在pH值不同的溶液中，蛋白質分子所帶的凈電荷多少不同。如在生理條件下，整個蛋白質所帶負電荷多，則為酸性蛋白質；帶正電荷多...

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證實好壞脂肪細胞的雙向互換

來自蘇黎世ETH的研究人員*次報道了活體中棕色脂肪細胞與白色脂肪細胞之間的轉換，這兩種細胞可以從一種細胞類型轉換成另外一種細胞類型。這項研究以小鼠這種模式動物作為研究對象，為棕色脂肪細胞的起源提出了一種新觀點，這也將有助于研發(fā)肥胖治療方法。人類和其他哺乳動物體內存在兩種類型的脂肪組織：白色脂肪組織（WAT）或稱為白色脂肪，用于儲存脂肪，另外一種是棕色脂肪組織（BAT）或稱為棕色脂肪，用于燃燒脂肪產生熱量，新出生的嬰兒就擁有大量棕色脂肪，并利用它來保持體溫。棕色脂肪也能用于代謝...

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展現(xiàn)病毒的薄弱環(huán)節(jié)

呼吸道合胞病毒RSV是一種RNA病毒，這種病毒的感染常見于三歲以下的兒童，有時會在嬰幼兒中引起嚴重的呼吸道疾病。現(xiàn)在，NIH旗下的美國國立過敏與感染性疾病研究所NIAID在四月二十五日的Science雜志上發(fā)表了一項新研究。他們在RSV關鍵蛋白與相應抗體結合時，對其進行了原子水平的成像，揭示了RSV關鍵組分上易受到抗體攻擊的位點。融合蛋白是RSV病毒的關鍵組分，在融合蛋白與人類細胞相互作用之前，存在一種融合前的形態(tài)。而這種融合前形態(tài)，特別容易受到中和抗體的攻擊。人體血液中絕大...

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歐核中心開發(fā)出廉價質子束癌癥療法

科技日報訊即便在物理學家眼里，歐核中心那些“上帝粒子”的研究人員也都是高高在上，但現(xiàn)在，由該研究小組開發(fā)出的一項新成果被稱為“終于和普通人生活有了關系”。據(jù)英國《每日郵報》在線版日前報道，致力于“上帝粒子”項目的科學家們，正在研究利用高能帶電粒子束治療癌癥患者，以代替一直廣泛使用、有強烈副作用的放射療法，而該方法的廉價與有望每年福澤數(shù)以萬計的癌癥患者。在位于日內瓦邊境的歐洲核子研究中心內，“上帝粒子”研究小組已開始與一家名為“腫瘤治療”的英國公司合作，力求降低新型替代技術的成...

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使用自動細胞計數(shù)器的三個tip

市場上近幾年涌現(xiàn)出不少自動細胞計數(shù)器。這種儀器利用光學顯微鏡技術，但帶來了更高的準確性、重復性，并將這一單調的工作自動化。樣品體積小也是這種細胞計數(shù)器的額外優(yōu)勢。許多儀器使用一次性的玻片，只需要10-20uL樣品。將玻片插入自動細胞計數(shù)器中，照相機捕獲圖像。隨后內置的軟件分析圖像，顯示細胞數(shù)量等信息。在此，專家介紹了使用自動細胞計數(shù)器的三個tip。準確對焦與其他光學顯微鏡一樣，儀器的準確對焦對于計數(shù)很關鍵。在手動計數(shù)時，訓練有素的大腦可輕松鑒定細胞。然而，自動細胞計數(shù)器內的照...

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解析病毒轉錄新機制

來自武漢大學生科院，Lerner研究所（LernerResearchInstitute）的研究人員發(fā)現(xiàn)水泡性口炎病毒VSV磷酸蛋白的三個磷酸化位點突變之后，會剝奪了功能性N-RNA模板的形成，從而影響病毒的轉錄復制。這不僅有助于分析磷酸化在磷酸蛋白P3A中所起的作用，而且也能揭示一些傳染病病毒的作用機理。文章的通訊作者是武漢大學生命科學學院教授陳明周博士，*作者為陳龍云博士。這一研究組主要研究方向為RNA病毒的基因表達和感染機制，病毒與宿主的相互作用，以及干擾素誘導的抗病毒機...

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人轉化生長因子酶聯(lián)免疫分析

人細胞因子試劑盒實驗原理本試劑盒應用雙抗體夾心法測定標本中人轉化生長因子α（TGF-α）水平。用純化的人轉化生長因子α（TGF-α）抗體包被微孔板，制成固相抗體，往包被單抗的微孔中依次加入轉化生長因子α（TGF-α），再與HRP標記的轉化生長因子α（TGF-α）抗體結合，形成抗體-抗原-酶標抗體復合物，經過*洗滌后加底物TMB顯色。TMB在HRP酶的催化下轉化成藍色，并在酸的作用下轉化成終的黃色。顏色的深淺和樣品中的轉化生長因子α（TGF-α）呈正相關。用酶標儀在450nm波...

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