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志賀氏菌屬(Shigella.spp)熒光定量PCR檢測試劑盒說明書

發(fā)布時間:2010/12/30點擊次數(shù):2736

 

志賀氏菌屬產(chǎn)品介紹
本試劑盒采用TaqMan探針法實時熒光PCR技術(shù),用于志賀氏菌的PCR體外特異性檢測。檢測靈敏度為100拷貝/mL。定量檢測線性范圍為:10-1010拷貝/mL。
志賀氏菌屬試劑盒組成

規(guī)格
48次檢測
DNA提取液
3mL/管
志賀氏菌PCR反應(yīng)液
1100µL/管
Taq酶(5U/µL)
24µL /管
志賀氏菌陽性對照
100µL/管
志賀氏菌陰性對照
100µL/管
說明書
1份

貯存與運輸條件
本試劑盒必須在-20℃下避光保存,有效期為6個月。
實驗操作步驟
1.         DNA提?。?/b>取增菌液1mL加到1.5mL無菌離心管中,10,000rpm離心5min,棄去上清;加入50µL DNA提取液,充分混勻后沸水浴5 min,13,000rpm離心5min,取上清液進(jìn)行檢測或保存于-20℃以待檢測。
2.         擴(kuò)增試劑準(zhǔn)備(在試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)完成
2.1.        從試劑盒中取出PCR反應(yīng)液,冰盒上融化后混勻。試劑在使用前2000rpm離心20s備用。
2.2.        設(shè)需要的PCR反應(yīng)管管數(shù)為N(N = 待檢樣本數(shù)+ 1管陰性對照 +1管陽性對照)。
2.3.        混合液的配制:先吸取體積為22.6(µL)×N反應(yīng)液1.5mL滅菌離心管,再加入Taq DNA聚合酶0.4 (µL)×N,混勻后2000rpm離心20s,然后向N 個0.2mL PCR反應(yīng)管中分裝已加入Taq酶的混合液23µL/每管,蓋緊管蓋。
2.4.        注意:陰性對照管建議在此區(qū)中加入2µL陰性對照樣品。
3.         加樣(在樣品制備區(qū)完成)
3.1.        陽性對照取出解凍,使用前2000rpm 離心20s。
3.2.        將保存在-20℃的核酸提取物置室溫解凍,以13,000rpm離心5min;向N個PCR管中分別加入待檢樣本DNA(包括陽性對照)2µL,蓋緊管蓋,2000rpm離心20s,將PCR反應(yīng)管轉(zhuǎn)移核酸擴(kuò)增區(qū)。注意做好樣品號標(biāo)記。
4.         PCR擴(kuò)增(在核酸擴(kuò)增區(qū)完成)
4.1.        上機(jī)前應(yīng)檢查各反應(yīng)管是否蓋緊。
4.2.        反應(yīng)體系設(shè)為25µL;熒光信號采集設(shè)定在退火溫度。對于多通道熒光PCR儀,選擇熒光素FAM為信號采集通道。
4.3.       PCR循環(huán)參數(shù)為:*階段,95℃  3 min預(yù)變性;
第二階段,[95℃ 10s;60℃ 40s] × 40次循環(huán)。
注意:在的LightCycler上使用,變性溫度95℃改為93℃,其他不變。
5.         質(zhì)量控制標(biāo)準(zhǔn)及結(jié)果判斷
5.1   綜合分析儀器給出的各項數(shù)據(jù)及擴(kuò)增曲線,設(shè)定合理的閾值(Threshold)和基線(Baseline),使儀器給出正確的結(jié)果。
5.2   陰性對照CT值應(yīng)顯示為0或≥40.0,陽性對照的CT值應(yīng)≤30.0,否則視實驗失敗,需重做。
5.3   檢測樣品CT≤35.0,結(jié)果有效,可直接報告樣品陽性。
5.4   檢測樣品35.0<CT>40.0,需進(jìn)行一次重復(fù)實驗,若CT仍介于35.0和40.0之間,且曲線有明顯的指數(shù)增長特性,同時陰性對照Ct值為零,可報告樣品陽性,否則報告樣品陰性。
5.5   檢測樣品CT值為零,報告樣本陰性。
適用熒光PCR儀品牌與型號
l         Cepheid公司的SmartCycler
l         ABI公司的Prism7000、7700、7500、9600系列
l         Stratagene公司的MX3000、MX4000
l         Corbett Research公司的Rotor-Gene 3000
l         Bio-Rad公司的iCycler系列、MJ opticon2
l         公司的LightCycler等
注意事項
1.         本試劑盒僅用于體外檢測使用,操作人員必須經(jīng)過培訓(xùn)并具有一定的經(jīng)驗,試劑盒使用前請仔細(xì)閱讀說明書全文。
2.         請嚴(yán)格按照基因擴(kuò)增檢驗實驗室的管理規(guī)范進(jìn)行實驗操作。
3.         PCR實驗嚴(yán)格分區(qū)操作;各區(qū)應(yīng)有的手套、移液器等,不得交叉使用,避免污染;工作人員應(yīng)遵循從一區(qū)到二區(qū)的單方向工作原則,各工作區(qū)相對隔離;進(jìn)行PCR實驗的工作桌面和及相關(guān)物品應(yīng)定期用1%次氯酸鈉、75%酒精、1mol/L鹽酸或紫外燈進(jìn)行滅菌和消毒。
4.         試劑盒中各試劑充分融化后請短暫離心。反應(yīng)液分裝時應(yīng)盡量避免產(chǎn)生氣泡。上機(jī)前應(yīng)注意檢查各反應(yīng)管是否蓋緊,以免污染儀器。
 
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